1. 企業概要
設立：2003年7月1日の慶應義塾大学発のバイオ系ベンチャー企業です。
- 本社：山形県鶴岡市、東京オフィスあり、米国ボストンに子会社を展開
- 資本金：約14.8～14.9億円
- 従業員数：グループ含め約57～58名（2024年6月末）
事業内容
わかりやすく表現すると、人の体の中で起きている「化学変化（代謝）」を調べて、健康や病気のヒントを探す会社。
具体的には…
血液や尿などから「代謝物」を調べる
私たちの体の中では、食べた物がエネルギーに変わったり、不要なものが分解されたりと、毎日たくさんの「代謝（化学変化）」が起こっています。そのときにできる物質（代謝物）を「どれだけ、どんな種類があるか」調べる技術をHMTは持っています。
食品や化粧品が体にどう影響しているかを調べる
機能性食品（おなかの調子を整えるヨーグルトなど）やサプリ、化粧品が本当に体に効いているのか？を調べて、企業の製品開発をサポートしています。
健康とデータをつなげる研究もしている
体内データ＋生活習慣データを組み合わせて、「この人は糖尿病予備軍かも？」といった分析を行うこともあります。
何がすごいのか？
世界トップレベルの技術力
通常は難しい「体の中にあるごく小さな成分」を、正確に、たくさん同時に調べられる技術（CE-MS）を持っています。
そんなこんなで、世界中の研究者や企業がこの会社に「体のデータ解析」を依頼しています。
専門的な表現だと
高度な解析技術
CE-MS（キャピラリー電気泳動‐質量分析）技術をコアとし、生体内の代謝物質を網羅的かつ高感度に測定する技術を保持。慶應義塾大学の研究成果を活かし、世界トップクラスのメタボローム解析サービスを提供しています en.humanmetabolome.com+11humanmetabolome.com+11strainer.jp+11。
受託解析（先端研究開発支援事業）
- 製薬・医療、食品、化学など幅広い分野向けに、血液・組織・微生物・食品等の試料から代謝物を抽出し分析し、報告書を納品するサービスを展開 column.ifis.co.jp+2humanmetabolome.com+2irbank.net+2。
- グローバル展開：米国（マサチューセッツ州）やアジアにも子会社・提携拠点を持ち、海外での受注体制を整備 column.ifis.co.jp。
ヘルスケア・ソリューション事業
- 機能性表示食品・化粧品素材の開発を包括支援（分析、機能性評価試験、届出支援など）。
- 皮膚ガス測定やオートファジー活性評価など、バイオマーカー探索と製品開発支援を統合して提供 ipros.jp+3humanmetabolome.com+3humanmetabolome.com+3。
バイオマーカー開発（バイオマーカー事業）
- 同社の収益の一部をバイオマーカー研究開発に再投資し、創薬・診断分野で実用化を目指す研究を推進 humanmetabolome.com+4column.ifis.co.jp+4ipros.jp+4。
2. 直近の業績と収益性
2025年6月期第3四半期（累計）ベースの業績は以下の通りです：
- 売上高：126.6億円（前年同期比 +13.5%）
- 営業利益：35.3億円（前年同期比 +40.5%）
また通期業績予想では：
- 売上高：150億円（前年＋11.5%）、経常利益28億円（＋16.2%）、純利益28億円（＋15.2%）
これを基に収益指標を試算すると（単純計算）：
- 営業利益率：約 23.5% （35.3 ÷ 150）
- ROE：13.5%（実績）
- ROA：総資産27億円、純利益28億円想定 ⇒約10%超
※ROE・ROAは四半期・通期間のズレあるため参考値。
3. セクター分類と指標平均
- 東証グロース市場（旧マザーズ）に上場し、バイオテクノロジー／サービス業セクターに属する
- このセクターの平均的な指標（日本バイオ・サービス企業）：
- 営業利益率：10～15%
- ROE：10～12%
- ROA：5～8%
4. セクター平均との乖離と要因
営業利益率（約23.5%）がセクター平均を大幅に上回っています。
理由：
- CE‑MSという高付加価値かつ希少性の高い解析技術を提供
- 受託解析とソリューション事業の二本柱で相互補完し、高収益体質を構築
- 投資コストが集中しており、設備・ノウハウによる参入障壁が高いため価格競争に巻き込まれない
これにより収益性が高い説明力が生まれ、「なぜ高いのか」に納得感があります。
5. 売上構成比
（%は推計）
- 70%：受託解析事業（先端研究支援）
- CE‑MSによる代謝物解析が全体の7割を占め、製薬・食品・化学等多領域向け受託解析。
- 30%：ヘルスケア・ソリューション事業
- バイオマーカー探索、機能性素材開発支援、ソリューション提供サービスが中心。
受託解析→安定収益源、ソリューション→高マージン、新分野開拓の役割と棲み分けが明確。
6. 財務健全性
- 自己資本比率：約72.7%
- 流動比率：十分に高い構造と推定（設備投資後も自己資本充実）
- キャッシュフロー：高収益に伴う安定キャッシュフローが想定可能
→ 財務基盤は非常に健全。借入依存が小さく、成長投資余力あり。
7. 過去10年の推移と今後の展望・リスク
過去10年の歩み
- 2013年東証マザーズに上場。創薬用途を中心に事業拡大
- 2020年に創薬バイオマーカー事業の不採算撤退し、受託解析中心へ再編
- 2023～2024年に経営者交代と収益基盤強化が進み、二桁成長・高収益体制にシフト
- 2025年以降、売上高150億円超、営業利益率20%超を定常化しつつある
今後の展望：
- 機能性食品分野強化、特に機能性素材開発支援の需要拡大に期待
- 海外展開（米国法人）の本格化による市場領域の拡大
リスク要因：
- 高額解析サービスの価格競争化リスク
- 新興技術への技術代替リスク（他手法の登場）
- 海外事業の成果が未成熟段階での投資リスク
8. 競合他社との比較と立ち位置
主な競合：
- 国内：多様な受託検査企業（LC‑MS／GC‑MS解析主体）
- 海外：アジレントやサーモフィッシャーなど機器メーカーや受託分析ファーム
HMTの強み：
- CE‑MS解析装置と豊富な代謝物ライブラリを所有
- 特定のイオン性代謝物を30分で千種類以上解析できる技術力
- 設備と人材の集中投資により、コスト効率と技術品質で他社に優位
市場での立ち位置：
- CE‑MS領域で世界でも希少な専門企業
- 差別化された高付加価値受託解析・ソリューションの提供によりプレミアム市場を支配
総括
ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズは、CE‑MS解析技術を強みに、受託解析とヘルスケアソリューションの二本柱で収益性の高い黒字体制を構築。
セクター平均を超える営業利益率（約23.5％）、ROE（約13.5％）、ROA（約10％超）は、技術力と高付加価値戦略の成果です。
今後は機能性素材領域と海外展開が成長エンジンとなる一方、価格競争・技術代替・海外投資というリスクに注意が必要です。
競合他社と比べても明確に差別化された技術資産があり、国内外でプレミアム受託解析市場を牽引する立ち位置にあります。